1、餵養不當：乳母乳汁不足時沒有及時添加代乳品、代乳品過稀或量不足，會導致寶寶蛋白質、熱能缺乏而造成慢性營養不良。寶寶4個月後沒有及時添加輔助食品或者驟然斷奶也會發生慢性營養不足。幼兒或學齡兒童的營養不良多是由於偏食、挑食、過多吃零食造成的。
2、疾病因素：多產、雙胞胎、早產兒由於先天不足，吸吮、吞嚥、消化吸收功能等都會比較差，容易出現營養不良的情況。反覆呼吸道感染、慢性腹瀉、寄生蟲病、慢性痢疾等疾病也會引起營養不良。
3、有些家長過分關注孩子的體重和身高等外部表現，忽略了孩子的各種營養成分的攝取，造成兒童營養不良。兒童營養不良並不都表現為體弱消瘦，肥胖、發育遲緩、認知能力和代謝能力低下等等都被認為是營養不良的表現，但有些營養不良在初期並沒有確切的症狀，也就不容易被發現，研究證明，兒童早期營養不良影響着身體和智能發育、認知功能發育、入學後的學習能力。
