1、使用器皿和材料：大豆500g；納豆菌0．3g或納豆半盒（25g）；高壓鍋；不鏽鋼盆；泡沫飯盒等淺容器；泡沫箱子；2立升長方形塑料瓶子或暖水袋；温度計。
2、蒸大豆，大豆充分洗淨後，加入3倍量的水浸泡一夜後，倒掉水放進高壓鍋內蒸到大豆用手捏碎的程度，大約45分鐘。如沒有高壓鍋煮也行，但煮時水一次不要放得太多。為了保持大豆的原汁原味，最好是蒸。
3、接種納豆菌，納豆菌在適宜的温度下，30分鐘就能增殖2倍左右。所以500g幹大豆，納豆菌的使用量只需0．3g。把它用50ml熱水溶解後，均勻地加入到熱大豆中，迅速攪拌均勻，分裝在7個泡沫飯盒裏，厚度大約50px，上面苫上紗布或者在飯盒與飯盒蓋之間架上一雙筷子，使其充分接觸空氣。因納豆菌是嗜氧菌，接觸空氣是很重要的。但發酵好以後，要蓋好蓋，用膠帶封住口。如用納豆製做，則選擇自己喜歡吃的那種商標的大豆，把它冷凍起來，做為菌種使用。500g幹大豆納豆菌的使用量為半盒（一盒50g）。把它加入到熱的大豆中，方法同上。
4、在恆温下發酵14—15小時，在乾淨的大泡沫箱內放入幾瓶裝滿50℃熱水的長方形塑料瓶子，把已接種上納豆菌的泡沫飯盒擺在瓶子上。箱內理想温度是42℃。如箱內温度降到37℃時，瓶內重新換入50℃的熱水。如此反覆更換瓶內熱水，發酵14—15小時，大豆表面產生了白膜，有粘絲出現後，大豆就變成了納豆。蓋嚴蓋，放入冰箱冷藏室低温保存。如沒有泡沫箱子，也可使用大紙盒，四周包上棉被和電褥子，或者箱內插入一隻45℃的電燈泡等方法來保持箱內恆温。注意多接觸空氣。
5、後熟，在40℃—42℃的恆温下發酵14—15小時，然後放在冰箱內低温熟成數小時後，做好的納豆無論是外觀還是口感都會更好。因此建議納豆做好後，先放入冰箱內低温熟成數小時以後再食用。
