1、吸收水分和無機鹽，根系從土壤中吸收水分的最活躍部位，是根端的根毛區。通常僅由根系的活動而引起的吸水現象，稱為主動吸水，而把由地上部分的蒸騰作用所產生的吸水過程，稱被動吸水。
2、固着和支持作用，根系將植物的地上部分牢固地固着在土壤中。
3、合成能力，根部能進行一系列有機化合物的合成轉化。其中包括有組成蛋白質的氨基酸，如穀氨酸、天門冬氨酸和脯氨酸等﹔各類植物激素，如：龍根生、 乙酸、細胞分裂素類，以及少量的乙烯等。
4、貯藏功能，根的薄壁組織發達，是貯藏物質的場所。
5、輸導功能，輸導功能是由根尖以上的部位來完成的。由根毛和表皮細胞吸收的水和無機鹽通過根的維管組織輸送給莖和葉的，而葉所製造的有機物也通過莖送到根，由根的維管組織輸送到根的各部分，維持根的生長和生活。
6、菌根和根瘤，許多植物的根系與土壤中的微生物建立了共生關係，在植物體上形成菌根或根瘤。某些種子植物的根與土壤真菌共生所形成的共生體，稱為菌根。
