一般分為經穴、經外奇穴和阿是穴、耳穴四類：
1、經穴：又稱十四經穴，是十二經脈和任脈、督脈循行路線上的腧穴，是全身腧穴的主要部分，計361個。
2、經外奇穴：凡未歸屬於十四經脈、定位明確、有特定療效的腧穴，稱為奇穴。
3、阿是穴：是病症在體表上的反應點，無固定部位，往往隨病而起，病癒即失。
4、耳穴：是病症在耳廓上的反應點，其分佈呈倒置胎兒狀。各腧穴雖經分類，但它們之間又有聯繫。不少奇穴位於十四經脈上，以後有歸屬於經穴的。不少阿是穴經過反覆實踐，確定其部位和主治作用，加以命名者，又成為奇穴。因此，腧穴的分類在歷史發展過程中並不是絕對的，它們相互補充，不斷髮展，形成腧穴的體系。
