1、液體石蠟儲存法就是在斜面菌種或穿刺菌種表面覆蓋一層液體石蠟，從而隔絕空氣，減少菌種及培養物水分揮發，保藏溫度要求在4℃下即可。
2、沙土儲存法沙土保藏法是將菌種吸附在適當的載體上，而後進行乾燥的保藏。將培養好的菌種接入沙土管內，用真空泵抽氣至幹。細菌、酵母菌、絲狀真菌均可用此法保藏，前兩者可保藏2年左右，有些絲狀真菌甚至可保藏14-17年之久。
3、甘油管儲存法甘油管儲存是利用微生物在甘油中生長和代謝受到抑制的原理達到保藏目的。配置30%濃度的無菌甘油，將培養好的菌種與甘油充分混合均勻，放入-20℃儲存。
4、冷凍乾燥保藏法冷凍乾燥儲存法就是將菌種與保護劑混合均勻後，快速冷凍，然後在減壓下利用昇華現象除去水分，兼具低溫、乾燥、除氧三方。乾燥後的菌種在真空環境下可長期儲存。
