計算機軟件著作權辦理流程如下：
一、網上填寫申請表
中國版權保護中心是國家版權局認定的唯一的軟件著作權登記機構，目前除北京地區設有軟件著作權代辦機構，其他各地都需要在中國版權保護中心進行軟件著作權登記。
1、註冊用户名（用於軟件著作權登記申請表的填寫、修改、打印），用户名和密碼一定要保存一下，以備將來辦理軟件著作權登記時要修改信息時所用。
2、將填寫完的軟件著作權申請表打印。
二、準備材料
1、軟件源程序代碼（A4紙打印，單面，1份）
前、後各連續30頁，共60頁，不足60頁全部提交，第60頁為模塊結束頁，每頁不少於50行（結果頁除外），在每頁的左側留出裝訂線，右上角打印或標註頁號1到60；
2、軟件用户手冊、操作手冊、設計説明書、使用説明書等任選一種；
3、身份證明。
（1）著作權人為個人
應提交身份證複印件一份，如有工作單位，可以要單位出具非職務軟件開發證明，也可以個人出具非職務軟件開發保證書（《非職務開發證明》、《非職務開發保證書》在官網上可下載）。
（2）著作權人為單位
企業法人或事業法人的應提交有效的企業法人營業執照或事業單位法人證書副本複印件，並需加蓋單位公章；社團法人單位提交民政部門出具的有效的社團法人證書的複印件；其他組織提交工商管理機關或民政部門出具的證明文件複印件。
4、委託辦理文件
（1）授權委託書
申請人委託代理人代為辦理軟件著作權登記申請的，應提交授權委託書。
（2）受委託人身份證複印件
5、其他證明文件：
（1）合作開發，合作開發合同書或合作開發協議書1份A4紙；
（2）委託開發，委託開發協議書1份A4紙；
（3）下達任務開發，任務書1份A4紙。
三、遞交文件
將以上材料提交到中國版權保護中心，經審查無誤後，受理員將在軟件著作權申請書上蓋章，然後到去繳費，拿到受理通知單。
四、領取軟件著作權登記證書
按照規定，在取得受理通知單30個工作日可以到中國版權保護中心領取軟件著作權登記證書。
