1、尾鰭。通過尾鰭的大小可以分辨孔雀魚的公母，公孔雀魚的尾鰭特別長，像蝴蝶的翅膀，而母孔雀魚的尾鰭要短上許多，呈小扇形。
2、背鰭。不單單是尾鰭，從背鰭的區別中也能分出孔雀魚的公母。如尾鰭一樣，公孔雀魚的背鰭比較長，而母孔雀魚的背鰭比較短，並且和尾鰭一樣也呈扇形。
3、腹鰭。公孔雀魚的腹鰭較窄，有些孔雀魚的腹鰭則較長、較短，但母孔雀魚的腹鰭較寬，如尾鰭、背鰭那般仍然呈現為扇形。
4、腹部。分辨孔雀魚的公母還可以看它們的腹部，母魚可見腹部內部的顏色，而公魚的腹部被白肚皮包着，看不見裏面的顏色，因此只有母魚有胎斑。此外，公魚身體更加豔麗，有漂亮的花紋，但母魚體色比較單一，缺少絢麗的花紋。
