一般來説，過濾系統都有四層，如下：
1、第一層過濾棉；
2、第二層生化棉；
3、第三層玻璃環，陶瓷環、生物石等；
4、第四層活性炭，吸氨石、麥飯石等。
過濾棉，是水族過濾系統中使用最普遍的一種濾材，具有良好的滲透性，過濾棉可以過濾大顆粒的雜質，提高水的透明度，生物菌也可在其上繁殖，分解水中的氨氮、亞硝酸鹽等有機物。
過濾棉屬於物理過濾的一種主要材質，物理過濾是通過水泵把魚缸中的水體抽入過濾槽，讓水通過過濾槽中的過濾棉等過濾材料，物理過濾不能去除水體中的小分子物質，過濾材料需要定期的清洗或者更換。
