1、先外後內。在發動機出現故障時，先對電子控制系統以外的可能故障部位予以檢查。這樣可避免本來是一個與電子控制系統無關的故障，卻對系統的傳感器、ECU、執行器及線路等進行復雜且又費時費力的檢查，即真正的故障可能是較容易找到卻未能找到。以進氣系統為例，ECU主要根據空氣流量計測得的空氣流量或進氣管壓力傳感器測得的進氣歧管壓力來控制噴油量，因此進氣系統密封不嚴而漏氣會導致發動機失調，造成怠速不穩、易熄火、動力性和加速性變差，對系統的影響程度要比化油器式發動機要大得多。診斷進氣系統故障時，首先應按未裝電控元件的基本診斷程序進行檢查排除；如故障仍未排除，並確認是進氣系統發生了故障時，首先應拆除空氣濾清器，進行目測檢查，排除一些一般性故障因素。
2、檢查的內容包括如下項目：
（1）檢查空氣濾清器濾芯及其周圍是否有髒物、雜質或其它污染物，必要時更換。
（2）檢查進氣管是否破裂、漏氣、老化或擠壞。
（3）檢查各傳感器與電腦的連接電線束是否鬆動或斷開，電線是否有磨破或線間短路、斷路的現象，電線插接頭是否插接就位，有無腐蝕現象等。
（4）檢查各傳感器是否有明顯的損傷。
3、先簡後繁。能以簡單方法檢查的可能故障部位先予以檢查。比如直觀診斷最為簡單，我們可以用看、摸、聽等直觀檢查方法將一些較為顯露的故障迅速地找出來。直觀診斷未找出故障，需藉助儀器儀表或其它專用工具來進行診斷時，也應對較容易檢查的先予以檢查。
4、先熟後生。由於電噴系統的構造和工作原理比較複雜，不同車型的電噴系統往往有較大的差異，在檢查與排除電噴系統的故障時，必須瞭解各電噴系統的工作原理和構造特點，參閲需修車型的詳細技術資料。
5、代碼優先。由於電噴系統愈來愈複雜，當發生故障時要判斷故障的部位就更困難。為方便檢修，現代電噴摩托車一般都有故障自診斷功能。當電噴發動機運行時，故障自診斷系統監測到故障後，便以代碼的方式將該故障儲存到電腦的存儲器內，同時通過警告燈向騎手報警。因此，檢修時應優先借助於ECU的故障診斷接口（插座），按特定的程序用人工跨接的方法或使用故障診斷儀，將ECU存儲器中的故障代碼調出，並以燈光閃爍的方式或直接由診斷儀顯示屏以數字形式顯示出來，從而幫助維修人員快速正確地判斷故障的類型和範圍。待故障代碼所指的故障消除後，如果發動機故障現象還未消除，或者開始就無故障代碼輸出，則再對發動機可能的故障部位進行檢查。故障排除後，同樣按特定的程序，用人工方法或藉助於診斷儀，將存儲在ECU存儲器中的故障代碼清除掉，以便記錄和存儲新故障碼。如果不清除舊的故障碼，當發動機再次出現故障後，ECU把新舊故障碼一併輸出，使得維修人員不知道哪些是發動機真正存在的故障，哪些是以前已經排除的故障，使新舊故障代碼混淆，給檢修帶來困難。
6、先思後行。眾所周知，亂拆瞎碰，只能將小故障變成大故障，甚至造成無法挽回的狀況，帶來不應有的損失。因此，必須首先對發動機的故障現象進行故障分析，瞭解可能的故障原因有哪些，然後再進行故障檢查。只有這樣才可避免故障檢查的盲目性：既不會對與故障現象無關的部位做無效的檢查，又可避免對一些有關部位漏檢而不能迅速排除故障。
7、先備後用。電噴系統的一些部件性能好壞，電氣線路正常與否，常以其電壓或電阻等參數來判斷。如果説沒有這些數據資料，系統的故障檢查將會很困難，往往只能採取新件替換的方法，這些方法有時會造成維修費用猛增且費工費時。因此在檢修時，應準備好維修車型的有關檢修數據資料。除了從維修手冊、專業書刊上收集整理這些檢修數據資料外，另一個有效的途徑是利用無故障車輛對其系統的有關參數進行測量，並記錄下來，作為日後檢修同類型車輛的檢測比較參數。如果平時注意做好這項工作，會給電噴系統的故障檢查帶來方便。特別注意：電噴發動機的故障並非一定出在電噴系統。如果發現發動機有故障，而故障警告燈並未點亮（未顯示故障代碼），大多數情況下，該故障可能與電噴系統無關，此時，就應該像發動機沒有裝電噴系統那樣，按照基本診斷程序進行故障檢查。否則，可能遇到一個本來與電噴系統無關的故障，卻檢查電噴系統的傳感器、執行器和電路等，花費了很多時間，而真正的故障反而沒有找到。
