防洪費應計入管理費用。防洪費會計處理如下：借：管理費用——小税種，貸：其他應付款——防洪費（或應交税費科目）。交納時：借：其他應付款——防洪費（或應交税費科目），貸：銀行存款。直接繳納防洪費時：借：管理費用——防洪費，貸：銀行存款。
防洪費也有叫堤圍費或圍堤費的（因剛開始時叫防洪費，後改為堤圍防護建設費，習慣上稱防洪費）。是按照企業的銷售收入的一定比例（各省市不同）由地税部門收取的專門用來防洪（堤圍）建設的費用。
它在企業的管理費用中列支，每半年申報徵收一次。有的地方比如天津市，防洪費是按照增值税、營業税、消費税的1%來提取的，並且是每月都要申報。
防洪費按照計徵流轉税的應納税營業額或銷售額進行計算徵收，如果沒有應税收入，應該進行零申報。其計算公式為：應繳防洪費=銷售（營業）收入×適用比率。
