1、體型區別：金波子魚的體型和它的性別有關。通常來説，身體比較圓潤，腹部比較大的是母魚。而體型比較細長，腹部比較小的是公魚。這是用來判斷金波子公母最可靠的依據。
2、魚鰭區別：一般來説，公金波子魚的尾部比較長，背鰭比較高，尾鰭也比較長。而母金波子魚的尾部比較短，背鰭比較矮，尾鰭也比較短。
3、腹部區別：一般來説，母的金波子魚的腹部帶有粉紅色的小斑點。而公的金波子魚腹部並沒有這種斑點。
4、顏色區別：一般來説，公金波子魚的體色比較鮮豔，而母金波子魚的體色比較暗淡。這是一般規律，用此法判斷基本是準確的，但是也有可能會有不符合此特徵的個例。
