1、最簡單的保存方法：如果冬蟲夏草不多，可找一個能密封的瓶子，將冬蟲夏草放進去，先用保鮮膜封好口，再旋緊瓶口，放於冰箱的冷藏室，便能保存很久。
2、用花椒除蟲去濕：冬蟲夏草的保存關鍵是防蟲、防蛀、防濕，為了防蟲，可在冬蟲夏草內放些花椒去蟲，再放些乾燥劑，然後密封於瓶子裏，這樣便能保存很久。
3、保存前放於冰箱的冷凍室一夜：如果擔心冬蟲夏草會生蟲，除再放些花椒外，還可將裝了冬蟲夏草的瓶子放於冰箱的冷凍室凍上一夜，將蟲卵凍死，就不會生蟲子了。
4、用太陽曬或炭火：如果發現冬蟲夏草已變軟受潮，可將之放於陽光下暴曬，或者放於炭火為烘烤一下，然後再裝於瓶口中密封保存。
5、用真空保存裝袋保存：市面上有一些可抽氣的真空保存袋，可購買一些小的袋子，用抽氣泵抽去裏面的空氣，然後放於冰箱冷藏，也可保存很久。
6、分包裝保存：任何中藥都是有保質期的，冬蟲夏草也如此，為了防止變質生蟲子、藥性不失效，一次性最好不要購買太多，最好能在半年內吃掉；如果購買量非常多，可將之拆成小包裝，分開保存。
