年度已預繳税額大於年度應納税額怎麼處理

1、《國家税務總局關於印發〈企業所得税彙算清繳管理辦法〉的通知 》（國税發[2009]79號）第十一條規定，納税人在納税年度內預繳企業所得税税款少於應繳企業所得税税款的，應在彙算清繳期內結清應補繳的企業所得税税款；

2、預繳税款超過應納税款的，主管税務機關應及時按有關規定辦理退税，或者經納税人同意後抵繳其下一年度應繳企業所得税税款。

3、按照上述規定，你公司可以到主管局申請辦理退税或者抵頂第一季度企業所得税預繳的税款。