1、車次不同。高鐵是以G開頭的車次，G是漢字高的拼音字頭。動車是以D開頭的車次，D是漢字動的拼音字頭。
2、速度不同。高鐵的時速在300公里以上，而動車的時速在200公里以上。
3、鐵軌不同。高鐵使用的鐵軌是專用鐵軌，這也是稱之為高鐵的原因。動車使用的鐵軌既可以是高鐵專用鐵軌，也可以是經過改裝的普通鐵軌，具有兼容性。
4、行駛的要求不同。高鐵可以稱作是專線，所以全線設置的站台很少。動車全線設置的站台就比較多，主要跑的是城際線。
5、動拖比不同。高鐵屬於強動力分散系統，動拖比（動車+拖車）小於1:1，大於1:3。動車屬於弱動力分散系統，動拖比一般都在1:5到1:6。
