合作社註冊商標的流程如下：
1、首先查詢商標名稱是否已有相同或相似商標存在，還需確認商標註冊的類別，註冊的商標所在的行業和服務。
2、接着準備材料：以個人名義提出申請，一般需要出示您的身份證及個體户營業執照的複印件。以企業名義來申請註冊，需出示企業《營業執照》副本複印件以及蓋有單位公章及個人簽字的填寫完整的商標註冊申請書。
3、然後向國家知識產權局商標局，申請商標註冊申請，或者委託商標代理機構委託商標代理機構，讓他們幫你做商標申請文件，以及提交商標申請文件。
4、其次商標註冊主管機關對商標註冊申請，進行商標審查(9—12個月)、初審公告和註冊公告(3個月)，公告無異議，就可以領取商標證。
5、最後關於註冊商標額費用，1枚商標1次申請官費為300元，可以選擇10個商品或服務類別，不足10個類別仍收取300元官費，超過10個類別超出部分按照30元/個類別收取官費。委託商標代理機構辦理的，申請人應向商標代理機構繳納商標註冊證明官費和代理費。
