零餘額賬户指財政部門或財政部門為預算單位在商業銀行開設的用於辦理預算資金支付清算的賬户，其日終餘額在與設立在中央銀行的國庫單一賬户清算後結零。
從零餘額賬户的概念來看，它是辦理預算資金支付清算的賬户。而就零餘額賬户的運作過程來看，它是一個過渡性賬户。
當符合預算規定的商品或勞務政府購買活動已經發生或完成，財政部門或其授權的預算單位向零餘額賬户發出支付指令，零餘額賬户在向商品或勞務供應商支付後，於日終前向國庫單一賬户申請清算，由國庫單一賬户將資金支付到零餘額賬户。可見，零餘額賬户的實質是過渡性支付清算賬户。
從財政集中支付的目的來看，零餘額賬户作為過渡性支付清算賬户，其核心是零餘額，即賬户日終餘額必須始終保持為零，以此保證國庫單一賬户對預算資金的集中管理，體現國庫單一賬户對支付的集中控制。正是由於這一性質，世界各國把這一賬户稱為零餘額賬户。
